Smart on aina unelmoinut työskentelemisestä kentällä urhean supertähden, agentti 23:n rinnalla. Sen sijaan Smart saa parikseen ainoan agentin, jonka henkilöllisyys on säilynyt salassa: ihastuttavan, mutta tappavan veteraaniagentin, agentti 99:n. Kun Smart ja 99 pääsevät lähemmäksi KAOS:n päämäärien – ja toistensa – selvittämistä, heille paljastuu että KAOS:n ykkösagentti Siegfried ja hänen apurinsa Shtarker yrittävät rahastaa luomansa kauhun verkoston avulla. Smartin, jonka kenttäkokemus, samoin kuin aika, on vähissä, ja joka on aseistettu vain muutamilla vakoojavempaimilla ja sammumattomalla innokkuudella, on tuhottava KAOS.